一男子结婚三年了，还是没有孩子，后来去检查了一下，该男子的精子可能质量比较低，可以让老婆怀孕，但是几率比较小，于是就偶然瞒着老婆去治疗一下，但是有一次老婆忽然告诉他一个好消息说自己怀孕了，不过这男的听到后不是惊喜，而且有点恐惧，担心孩子不是自己的。于是男的对老婆说：防止肚子里面的胎儿基因发生变异还是去做个亲子鉴定吧，但是老婆就是不同意，如果遇到这种情况该怎么处理。
如果女方不同意做亲子鉴定，男方可以考虑以下两种处理方式：
父子亲子鉴定：男方可以选择自己和孩子一起进行亲子鉴定，即父子亲子鉴定。虽然通常情况下需要母亲的样本来对比，但如果男方对母亲的配合无法得到，父子亲子鉴定也可以提供一定的结果。男方可以前往亲子鉴定机构进行鉴定，或者自行在家采集样本并邮寄给鉴定中心。
进入诉讼程序：如果男方怀疑孩子非亲生，并且女方拒绝做亲子鉴定，男方可以向人民法院起诉请求确认亲子关系不存在。男方需要提供必要的证据来支持自己的主张，如果女方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定，法院可以推定男方的主张成立。在大多数诉讼案件中，如果男方提供了必要的证据，并且女方没有提供相反证据并拒绝做亲子鉴定，法院通常会支持男方的请求。
总结：如果女方不同意做亲子鉴定，男方可以选择父子亲子鉴定或者进入诉讼程序请求确认亲子关系不存在。然而，在处理这种问题时，应当慎重考虑并尽量保持沟通和理解，确保家庭关系的稳定和幸福。
