DNA亲子鉴定，判定亲生关系的理论依据是孟德尔遗传的分离律。按照这一规律，在配子细胞形成时，成对的等位基因彼此分离，分别进入各自的配子细胞。精、卵细胞受精形成子代，孩子的两个基因组一个来自母亲，一个来自父亲，因此同对的等位基因也就是一个来自母亲，一个来自父亲。鉴定结果如果符合该规律，则不排除亲生关系，若不符合，则排除亲生关系（变异情况除外）。
亲子鉴定可以鉴定的亲缘关系有几种？
其实亲子鉴定不仅能鉴定出亲生父母，还可以进行亲缘关系鉴定，目前亲缘关系鉴定包括以下几类：
1、常规的亲生血缘关系鉴定
这是目前需求量最大的一类亲权关系鉴定，包括父母子三方（又称为三联体）、父子（或母子）双方（又称为二联体）的亲权鉴定。这类鉴定的准确率可以达到99.999999%。
2、隔代亲缘关系鉴定
这类鉴定指要确认曾祖父母、祖父母与曾孙子（曾孙女）、孙子（孙女）之间的亲缘关系。还包括单纯的父系亲缘关系鉴定，如要确认曾祖父、祖父、与曾孙子、孙子之间的亲缘关系，以及单纯的母系亲缘关系鉴定，如要确认曾祖母，外祖母与外孙女，曾外孙女之间的亲缘关系。
3、疑难的亲缘关系鉴定
除上述两类外，还有一些比较疑难的亲缘关系鉴定，如父母皆疑的同胞（兄弟、兄妹、姐弟、姐妹）、表兄妹关系的鉴定，叔侄之间、姨和外甥女之间、舅舅与外甥（外甥女）之间的亲缘关系鉴定等。
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